O Centro de Ciências Exatas e Naturais foi base para a formação para o que iria se tornar Departamento de Física, Estatística e Matemática. Desde o início formal de sua atual estrutura (primeira metade da década de 1990), o DeFEM contou com a participação de professores russos, devido ao convênio firmado pela FIDENE/UNIJUÍ e Universidade Estatal Técnica de Kazan (Rússia). Além dos cursos de Graduação, o DeFEM ainda oferece o Programa de Mestrado em Modelagem Matemática.

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