A Agência de Inovação e Tecnologia da UNIJUÍ (AGIT/UNIJUÍ) é uma instância estratégia da Universidade constituída em conformidade com as discussões institucionais estabelecidas no decorrer de 2005 e 2006, que atua como uma instância articuladora e facilitadora de instituições, integradora dos processos administrativos e jurídicos de inovação e tecnológica desenvolvidos prioritariamente a partir da interação Universidade-Empresa. Este novo mecanismo adotado pela instituição visa concretizar ações para a sustentabilidade universitária, a proteção do conhecimento produzido na universidade, além de responder às reivindicações, internas e externas, pela contribuição da universidade para modernização tecnológica em sua área de atuação.