A exposição permanente do Museu Antropológico Diretor Pestana ocupa uma área de 500m2.

O objetivo da mesma é retratar aspectos da caminhada do homem que viveu e vive nesta região do Estado, sobretudo, no município de Ijuí.  Inicia com o índio pré-missioneiro, primeiro habitante desta região, com seus instrumentos em pedra e cerâmica, seguido do índio missioneiro, principalmente, através de sua arte e dos bens culturais produzidos por seus descendentes, hoje, no Rio Grande do Sul.

O negro e o caboclo que aqui habitaram antes da chegada dos imigrantes são retratados a seguir. A exposição destaca ainda, aspectos da fundação e colonização do município, a imigração e, facetas da agricultura e trabalho rural, os processos produtivos artesanais; comunicação e transporte; indústria e comércio; energia; serviços; esporte e lazer; ensino; religião; usos e costumes e a moradia.

O espaço final da exposição foi reservado às manifestações culturais de Ijuí hoje.