A Coordenadoria de informática tem a responsabilidade de definir, executar e orientar as políticas de tecnologia da informação da FIDENE e suas mantidas. A estrutura está dividida em três Núcleos: Desenvolvimento de Sistemas, Redes e Banco de Dados, Suporte ao Usuário.

Núcleo de Desenvolvimento de Sistemas

Núcleo responsável pelo planejamento, análise, e desenvolvimento dos sistemas de informação da Instituição, este núcleo esta organizado em cinco áreas que são: 

Núcleo de Redes e Banco de Dados

O Núcleo de Redes e Banco de Dados está dividido em duas áreas. Uma é responsável pela administração do banco de dados Institucional, garantindo a segurança, integridade e disponibilidade de acesso de acordo aos direitos de acesso dos usuários. Já a área de redes é responsável pelo projeto de novas estruturas de rede, instalação, configuração e manutenção dos servidores e demais equipamentos de rede da Instituição.

Núcleo de Suporte ao Usuário

Este Núcleo é responsável pela manutenção de todo parque de microcomputadores da Instituição, provendo a instalação, configuração e manutenção dos equipamentos e softwares neles instalados. Também cabe a este Núcleo a configuração das centrais telefônicas, serviços de telefonista e serviços de atendimento nos laboratórios de informática da Instituição.